Кишечный виром
Кишечный виром
Ксения Мальцева Опубликована сегодня в 10:26

Геномы придумал ИИ: вирусы, которых раньше не существовало, стали реальностью

bioRxiv: ИИ-модель Evo создала геномы вирусов для фаговой терапии и генной медицины

Вирусы обычно ассоциируются с болезнями, но в лабораториях они всё чаще становятся инструментом медицины и биотехнологий. Учёные Стэнфордского университета сделали шаг, который может изменить синтетическую биологию: впервые искусственный интеллект самостоятельно создал жизнеспособные вирусные геномы. Из 302 спроектированных вариантов 16 оказались функциональными — они смогли размножаться и уничтожать бактерии, сообщает bioRxiv.

Как ИИ собрал вирус

Исследователи использовали модель Evo — аналог больших языковых моделей (по принципам напоминает ChatGPT), но обученную не на текстах, а на геномах около двух миллионов бактериофагов. Эти вирусы поражают бактерии и используются как основа для медицинских исследований.

Для эксперимента выбрали фаг phiX174 — самый простой вариант с 11 генами и всего 5000 "буквами" ДНК. Именно на нём проверили возможности ИИ.

Результат

Из сотен предложенных ИИ геномов 16 оказались полностью жизнеспособными: они успешно атаковали кишечную палочку в лабораторных условиях.

"Это было довольно поразительно — просто увидеть такой геном, созданный ИИ", — отметил Брайан Хи, руководитель лаборатории института Arc.

Сравнение: ИИ и первые эксперименты

Год Достижение Методы
2002 Создание синтетического вируса полиомиелита в Нью-Йорке (Э. Виммер) Сборка РНК из химических фрагментов
2025 ИИ создал рабочие геномы вирусов в Стэнфорде Модель Evo, обученная на миллионах геномов

Зачем это нужно

Открытие открывает путь к нескольким направлениям:

  • фаговая терапия — лечение бактериальных инфекций без антибиотиков;

  • генная терапия — доставка полезных генов в клетки человека;

  • биоинженерия — создание инструментов для изучения генома и белков.

Советы шаг за шагом: как работает процесс

  1. Выбор целевого вируса (например, фаг phiX174).

  2. Обучение ИИ на базе миллионов геномов.

  3. Генерация сотен новых вариантов.

  4. Лабораторный синтез ДНК.

  5. Проверка жизнеспособности и репликации в клетках.

Ошибка → Последствие → Альтернатива

• Ошибка: тестировать ИИ сразу на патогенных для человека вирусах.
• Последствие: потенциальная угроза биобезопасности.
• Альтернатива: использовать безопасные модели, такие как бактериофаги.

• Ошибка: полагать, что ИИ способен собрать любой организм.
• Последствие: завышенные ожидания.
• Альтернатива: ограничивать исследования микроорганизмами с простыми геномами.

А что если…

А что если технологии доведут до уровня, когда ИИ сможет проектировать вирусы, действующие как лекарства? Тогда появятся "умные" фаги, уничтожающие только патогенные бактерии и оставляющие в покое полезную микрофлору.

FAQ

Почему выбрали именно phiX174?
Это один из самых простых фагов, удобный для тестов.

Можно ли повторить эксперимент с вирусами человека?
Теоретически да, но это создаёт угрозы, поэтому пока исследования ограничиваются фагами.

Заменят ли вирусы, созданные ИИ, антибиотики?
Нет, но они могут дополнить или заменить антибиотики там, где резистентность слишком высока.

Мифы и правда

• Миф: ИИ уже может создавать любые вирусы.
Правда: пока речь идёт только о простых бактериофагах.

• Миф: синтетические вирусы опаснее естественных.
Правда: их делают управляемыми и безопасными для человека.

• Миф: это изобретение позволит "создать жизнь с нуля".
Правда: технология ограничена микроорганизмами и требует живых клеток для активации.

Три интересных факта

  1. PhiX174 — первый вирус, чей геном полностью секвенировали ещё в 1977 году.

  2. Сложность генома кишечной палочки в тысячу раз выше, чем у исследованного фага.

  3. Первые опыты синтетической вирусологии начались более 20 лет назад.

Исторический контекст

• 2002 год — Эккард Виммер впервые собрал вирус полиомиелита из химических фрагментов.
• 2010 год — создание первой синтетической бактериальной клетки (Дж. Крейг Вентер).
• 2025 год — ИИ впервые спроектировал жизнеспособные вирусы.

Подписывайтесь на Moneytimes.Ru

Читайте также

В Польше нашли редкую бронзовую булавку ясторфской культуры II века до н. э. сегодня в 1:55

На одном месте сошлись века: топор, фибулы и культовые предметы обнаружили вместе — и это даёт новую версию прошлого

В Польше обнаружили редкую бронзовую булавку ясторфской культуры II века до н. э. на фоне других находок от античности до Второй мировой.

Читать полностью »
Сейсмолог Завьялов объяснил рост активности на Камчатке разрядкой напряжений с 1952 года сегодня в 11:17

Камчатку снова трясёт: учёные объяснили, почему это было предсказуемо — но расслабляться рано

Повышенная сейсмическая активность на Камчатке объясняется разрядкой тектонических напряжений, накопленных с 1952 года.

Читать полностью »
В Векторе разработали безыгольную ДНК-вакцину от COVID-19 с новым способом введения сегодня в 11:12

Струя вместо иглы: вакцинация теперь длится полсекунды и не оставляет следов

Учёные центра "Вектор" разработали безыгольную ДНК-вакцину от COVID-19, которая вводится с помощью микроструи со скоростью 220 м/с.

Читать полностью »
ИИ по маммограмме предсказал риск сердечно-сосудистых заболеваний у женщин сегодня в 11:11

Маммография предсказала больше, чем ожидали: ИИ увидел в снимках не только риск рака — и это меняет подход к скринингу

Алгоритм ИИ по маммограмме точно предсказывает сердечно-сосудистые риски у женщин и может дополнить скрининг.

Читать полностью »
Полина Дроздова: рачки Байкала используют пигменты как солнцезащитные очки для глаз сегодня в 11:03

В темноте броня не нужна: почему на глубине рачки теряют свой яркий цвет

Учёные ИГУ обнаружили у байкальских рачков «солнцезащитные очки». Пигменты защищают их клетки от ультрафиолета, а в темноте глубин окраска исчезает.

Читать полностью »
Учёные из Канзаса связали сильный иммунитет с хроническим воспалением сегодня в 11:01

Почему организм сам себя разрушает? Иммунные клетки активируют белок-убийцу даже без инфекции

Учёные из Канзаса показали, что сильный иммунитет может вызывать хроническое воспаление через механизм пироптоза.

Читать полностью »
Муравьи Messor ibericus способны производить потомство другого вида сегодня в 10:55

Потомство чужого вида — это не ошибка: муравьи-жнецы делают то, что считалось невозможным

Учёные обнаружили, что муравьи Messor ibericus способны производить потомство другого вида — Messor structor.

Читать полностью »
Учёные связали хроническую бессонницу с деменцией и ускоренным старением мозга сегодня в 9:33

Сон ушёл — здоровье за ним: одно хроническое состояние запускает цепочку тяжелейших болезней

Хронический недосып резко увеличивает риск деменции, заболеваний сердца, диабета и ожирения.

Читать полностью »