Мутационный след коронавируса нашли учёные РАН. Поставлена точка в теории происхождения ковида

Учёные Института проблем передачи информации РАН обнаружили необычную закономерность в накоплении точечных мутаций в геноме коронавируса SARS-CoV-2, отличающую его от других известных коронавирусов.

Результаты исследования опубликованы в международном журнале PeerJ и, как утверждают авторы, дают новые аргументы в пользу природного происхождения вируса и его недавней адаптации к организму человека.

"Мы выявили резкое увеличение специфического типа мутаций — замен гуанина на урацил — в геноме SARS-CoV-2 после его перехода к человеку. Этот механизм не характерен для других коронавирусов, включая SARS и HKU1", — объясняют авторы исследования, Александр и Юрий Панчин.

Что именно обнаружили учёные?

Анализируя более тысячи геномов SARS-CoV-2 и сравнивая их с сотнями последовательностей других коронавирусов (SARS, HKU1 и родственных вирусов, выделенных у животных), исследователи зафиксировали резкий рост частоты замен гуанина на урацил — до 15% от всех мутаций. Это почти в десять раз выше, чем у вируса до его попадания в человеческую популяцию.

Для сравнения, у SARS (вирус атипичной пневмонии) и HKU1 (коронавируса простуды), даже после перехода к человеку, подобных изменений почти не наблюдается — их доля стабильно низка.

Авторы предполагают, что этот всплеск мутационной активности связан с особенностями иммунной защиты: у летучих мышей вирусы защищены от мутагенных воздействий, тогда как в человеческом организме такой защиты нет, и РНК вируса подвергается окислительному стрессу, провоцируя мутации.

Специалисты отдельно отметили и причины важности изучения данного явления:

• Прямое указание на недавнюю адаптацию: подтип мутаций G→U типичен для ситуаций, когда вирус оказывается в новом для себя биологическом окружении.
• Подтверждение естественного происхождения: подобный сценарий трудно объяснить лабораторной адаптацией — скорее всего, он связан с природной эволюцией вируса при передаче от животного-хозяина к человеку.
• Новая база для молекулярной эпидемиологии: тип и частота мутаций могут стать маркерами адаптации и устойчивости вирусов в новых популяциях.

Интересно, что наблюдаемая мутационная активность одинакова как в выборках из Китая, так и из США — что говорит о глобальном и универсальном характере этого явления.